Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms