Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A430089I19RikQ8C9W1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms