Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc60Q8C4J0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc60Q8C4J0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms