Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FarsaQ8C0C7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms