Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccser1Q8C0C4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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