Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube3dQ8BX13 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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