Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms