Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak4Q8BTW9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pak4Q8BTW9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms