Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia2Q8BSS9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms