Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LsampQ8BLK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms