Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan12Q8BKT6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms