Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms