Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms