Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-M10.2Q85ZW9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M10.2Q85ZW9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms