Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.5Q85ZW7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.5Q85ZW7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms