Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms