Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfascQ810U3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms