Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms