Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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