Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NanogQ80Z64 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms