Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbbp8Q80YR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms