Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3bQ80YF6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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