Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc28Q80XJ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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