Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln4Q80WM4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms