Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup214Q80U93 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms