Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms