Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf7ipQ7TT18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms