Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp6r1Q7TSI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp6r1Q7TSI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms