Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Clec4b1Q7TS58 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Clec4b1Q7TS58 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms