Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf18Q7TS55 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms