Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nphp3Q7TNH6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms