Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shq1Q7TMX5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms