Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf2Q7TMI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms