Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl35Q6ZWV7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms