Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms