Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b3Q6UQ17 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms