Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc154Q6RUT8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc154Q6RUT8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms