Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms