Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad54bQ6PFE3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms