Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms