Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms