Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RgmaQ6PCX7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms