Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Herc4Q6PAV2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms