Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl2Q6PA06 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms