Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf2Q6P9P0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms