Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms