Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh2Q6P6J4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh2Q6P6J4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms