Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc148Q6P5U8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc148Q6P5U8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms