Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp12Q6P5B0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms