Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm2bQ6P1G2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms